দুস্থ মানবতার সেবা বিভাগ মাদরাসার মানবকল্যাণমূলক একটি গুরুত্বপূর্ণ শাখা। এ বিভাগের মূল উদ্দেশ্য হলো অসহায়, দরিদ্র ও বিপদগ্রস্ত মানুষের পাশে দাঁড়িয়ে মানবতার সেবা করা, যা ইসলামের অন্যতম মৌলিক শিক্ষা।

এই বিভাগ থেকে খাদ্য সহায়তা, বস্ত্র বিতরণ, চিকিৎসা সহায়তা এবং জরুরি ত্রাণ কার্যক্রম পরিচালনা করা হয়। নিঃস্বার্থ সেবা ও সহানুভূতির মাধ্যমে এ বিভাগ সমাজে ইসলামের মানবিক রূপ তুলে ধরে এবং ভ্রাতৃত্ববোধ ও সামাজিক দায়িত্ববোধ জাগ্রত করে।